Versions Compared

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.

...

  1. Přichycení k flow cell – Adaptéry obsahují specifické sekvence, které se vážou k povrchu sekvenačního čipu (flow cell) během sekvenace na platformách Illumina.

  2. Amplifikace – Obsahují primovací sekvence, které umožňují PCR amplifikaci knihovny v případě PCR-based protokolů (v případě PCR-free knihoven k amplifikaci nedochází).

  3. Indexování (barcoding) – Často obsahují unikátní sekvence tzv. indexy (krátké unikátní sekvence DNA, např. 8–12 bází dlouhé), které umožňují přiřadit fragmenty DNA k určitému vzorku při multiplexním sekvenování (kdy se více vzorků sekvenuje najednou, což snižuje čas a náklady na analýzu). Sekvenování probíhá standardně, ale software zároveň čte i indexové sekvence. Po sekvenaci se softwarem provede „demultiplexing“, což znamená rozdělení přečtených dat zpět na jednotlivé vzorky podle jejich indexů.

    image-20250129-131956.pngImage Added

Proč se ale DNA rozděluje na menší části?   

...